全球基因組投入哪最大?不是美國,是中國深圳
2015-03-05
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從癌癥篩查到提供個體化治療,從罕見病到首個基因篩查體外受精(IVF)嬰兒誕生,中國在下一代基因測序技術(shù)日趨白熱化的全球競賽中表現(xiàn)非凡,大數(shù)據(jù)和基因組網(wǎng)絡(luò)僅是其中之一,全球最大基因組機構(gòu)——華大基因(BGI)CEO王俊如是說。
北京——2012年8月24日,當世界首例胚胎移植前接受全基因組篩查的試管嬰兒(IVF)在中國湖南省誕生之時,喜悅之情洋溢在中國基因組學者和醫(yī)學專家心中。
中國屬于出生缺陷率較高的國家,高達5.6%,即100例新生兒中出生缺陷嬰兒超過5例。總體上,約有8,000種單基因突變導致的缺陷疾病,這給家庭和社會帶來巨大負擔。
因此,產(chǎn)前基因檢測在中國就顯得非常重要,全球最大基因組機構(gòu)華大基因的CEO王俊1月30日在北京召開的未來論壇上指出。
“在1,500對進行基因檢測的新婚夫婦中,我們發(fā)現(xiàn)85對夫婦具有生育出生缺陷嬰兒的高風險。”
而在中國某些地區(qū),這種風險更高,這也將改變生活在出生缺陷疾病高發(fā)地區(qū)人們的命運。這些地區(qū)包括中國南方省份廣東和廣西,一種罕見血液病地中海貧血在當?shù)鼐用裰邪l(fā)病率較高。
華大與湖南中信湘雅醫(yī)院合作,應(yīng)用下一代基因測序技術(shù)對IVF胚胎開展基因異常檢測。通過胚胎植入前測序,該研究院從受精數(shù)日后形態(tài)學正常的胚胎中去除了7~12個受精卵。
自2010年以來,已有33對夫婦的胚胎經(jīng)測序后植入,22對成功受孕,成功率為66.7%。截至目前,已誕生17個健康嬰兒。
此外,唐氏綜合癥無創(chuàng)產(chǎn)前篩查越來越價廉,一次檢測費用為1,000~2,000人民幣元(160~320美元)?;驒z測不僅可預(yù)防出生缺陷,還可發(fā)現(xiàn)出生后的潛在風險,如鏈霉素導致的耳聾,王俊說道。
對于攜帶遺傳性基因異常但未出現(xiàn)疾病癥狀者來說,他們是真正的“超級英雄”。這些萬幸中的幸運兒只占人群中的17/1000000,但他們可以提供破解這些疾病的寶貴線索。
基因檢測, 免費?
王俊指出,基因組檢測發(fā)展之迅速,費用下降之快,已遠遠超出了著名的摩爾定律。
由英特爾總裁Gordon Moore首次提出的這一定律認為,每隔18~24個月,半導體容量將翻番,而價格下降一半。
在人類基因測序檢測之初,每個基因組檢測費用約1億美元,而現(xiàn)在的費用降為數(shù)千美元,相當于數(shù)千元人民幣。
王俊預(yù)測,按照目前趨勢發(fā)展,基因測序最終將會免費。再過4年,即到2019年將有可能變?yōu)楝F(xiàn)實。
如同計算機的演變,從個人計算機發(fā)展到互聯(lián)網(wǎng),基因組研究正從個體檢測向“基因組互聯(lián)網(wǎng)”發(fā)展。
這種基因組網(wǎng)絡(luò)將分享相同疾病患者的經(jīng)驗,提供相互幫助。在美國, Patientslikeme 網(wǎng)站已經(jīng)提供這類服務(wù)。
與此同時,獲得基因組信息的醫(yī)生,將能夠提供更加快速和準確的診斷。實際上,未來醫(yī)生的患者診斷工作甚至將會被完備的基因組網(wǎng)絡(luò)所取代。
但其中的關(guān)鍵是如何把握好隱私保護與科學研究之間的平衡,王俊說道。
大數(shù)據(jù),競爭熾烈
全球范圍內(nèi)基因組測序競賽急劇升溫。政府、研究機構(gòu)以及研發(fā)合同組織CRO均試圖建立大型基因庫以解決日益昂貴的醫(yī)療問題。
王俊稱,目前面臨的挑戰(zhàn)是解釋輸入與輸出,即程序化工作程序。目前,華大已明確將大數(shù)據(jù)作為突破重點。
為此,BGI與研究組織全力合作,開展腫瘤轉(zhuǎn)化研究及農(nóng)作物和動物(如水稻和豬)基因檢測。
BGI將關(guān)注點鎖定在建立一個含有1億人的DNA組合的數(shù)據(jù)庫。目前全球3大基因組機構(gòu)的基因測序能力僅為一年18,000份樣本,因此這一目標顯得頗具野心。
BGI的BGISEQ-1000測序儀已獲得中國監(jiān)管機構(gòu)的首個批準,這是該公司收購美國Complete Genomics公司后得到的基因組測序平臺。
中國最大的合同研究組織無錫藥明康德也收購了美國NextCODE Health,整合至自己的基因組實驗室,以提高其服務(wù)提供和數(shù)據(jù)分析能力。
世界各地紛紛開展基因組測序的浩大項目。在美國,此前領(lǐng)銜人類基因組計劃的NIH院長Francis Collins已警告說,美國的領(lǐng)先地位正在遭受中國的快速侵蝕。
“不過,如果你現(xiàn)在問我全球基因組投入最大的地方在哪兒,它不在美國,而是在中國的深圳,” Collins在去年9月的美國國會聽證會上說道。
“他們在研讀我們的范本,他們尋找機會所在,他們在利用這個機會。”