日前,Nature雜志展開(kāi)了本年度的年終大盤點(diǎn),選出了十位舉足輕重的科學(xué)人物。結(jié)構(gòu)生物學(xué)家Sjors Scheres因開(kāi)發(fā)了RELION軟件包,將冷凍電鏡圖像轉(zhuǎn)變?yōu)榫?xì)的分子結(jié)構(gòu)而入選。
Sjors Scheres
核糖體是合成蛋白質(zhì)的復(fù)雜分子機(jī)器,今年Scheres獲得了迄今為止最清晰的核糖體圖像。然而,作為一個(gè)結(jié)構(gòu)生物學(xué)家他最感興趣的并不是核糖體,“我的主要貢獻(xiàn)是數(shù)學(xué)方面的,” Scheres說(shuō)。
Scheres的數(shù)學(xué)為結(jié)構(gòu)生物學(xué)帶來(lái)了一場(chǎng)革命。這一領(lǐng)域曾經(jīng)是X射線晶體學(xué)技術(shù)的天下,現(xiàn)在冷凍電鏡(cryo-EM)卻占據(jù)了優(yōu)勢(shì),這多虧了Sjors開(kāi)發(fā)的軟件。這個(gè)軟件能夠?qū)ryo-EM圖像轉(zhuǎn)變?yōu)榫?xì)的分子結(jié)構(gòu),讓生物學(xué)們更簡(jiǎn)單更清晰的看到分子機(jī)器。
2010年Scheres加入MRC分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室之后,顯微鏡技術(shù)經(jīng)歷了一次較大的發(fā)展。Scheres意識(shí)到需要更好的計(jì)算機(jī)程序來(lái)解讀大量的數(shù)據(jù),于是他把自己關(guān)在辦公室里寫(xiě)了一個(gè)出來(lái),這就是RELION。
“他一個(gè)人呆了幾年,然后就拿出了這個(gè)美妙的軟件,”2009年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)得主Venki Ramakrishnan說(shuō)。Ramakrishnan曾通過(guò)X射線晶體學(xué)技術(shù)揭示了細(xì)菌核糖體的結(jié)構(gòu),而Cryo-EM能夠更快更好地完成這項(xiàng)工作。
今年,Ramakrishnan與Scheres合作為人們展示了酵母和人類核糖體的精密結(jié)構(gòu)?,F(xiàn)在Ramakrishnan實(shí)驗(yàn)室基本上已經(jīng)改用冷凍電鏡了。
Scheres還在破解更多更復(fù)雜的結(jié)構(gòu)。舉例來(lái)說(shuō),他和清華大學(xué)施一公教授合作確定了γ-分泌酶的結(jié)構(gòu),這是一種與阿爾茨海默癥有關(guān)的蛋白。
就在不久前,Sjors Scheres教授課題組又和清華大學(xué)的顏寧教授、施一公院士的研究團(tuán)隊(duì)合作通過(guò)單顆粒低溫電子顯微技術(shù),解析了兔RyR1與其調(diào)節(jié)子FKBP12結(jié)合時(shí)的結(jié)構(gòu),總體分辨率達(dá)到了3.8 Å。這一成果于12月15日發(fā)表在Nature雜志上網(wǎng)站上。
Sjors Scheres教授還曾多次來(lái)中國(guó)向從事冷凍電鏡研究應(yīng)用的學(xué)者講解其開(kāi)發(fā)的軟件包RELION,并介紹最大概然統(tǒng)計(jì)分析理論和貝葉斯理論在電鏡圖像分析和三維重構(gòu)中的重要應(yīng)用,為我國(guó)冷凍電鏡圖像分析領(lǐng)域帶來(lái)了最前沿的理論。
Sjors Scheres教授在第七屆郭可信電子顯微學(xué)和晶體學(xué)暑期學(xué)校期間作報(bào)告
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